Das Präsidium trägt die Gesamtverantwortung des Verbands. Es wird von der Mitgliederversammlung gewählt und arbeitet ehrenamtlich.
Die Präsidiumsmitglieder repräsentieren den Verein nach innen und nach außen. Sie beraten über seine strategische und inhaltliche Ausrichtung. Das Präsidium besteht aus Vertretern klinischer und theoretische Fächer. Die Präsidiumsmitglieder sind Repräsentanten bzw. Entscheidungsträger aus den Medizinischen Fakultäten.
Dekan der Medizinischen Fakultät der Julius-Maximilians-Universität Würzburg
Dekanin der Medizinischen Fakultät der Universität Augsburg
Dekan der Medizinischen Fakultät der Universität Ulm
Generalsekretär des Medizinischen Fakultätentages
Vorstandsvorsitzender des Berlin Institute of Health
Dekan der Medizinischen Fakultät der Universität zu Köln
Fachbereich Medizin der Philipps-Universität Marburg
Vorstand der DHM AG Personalentwicklung
Dekanin der Medizinischen Fakultät der Universität Hamburg
Dekan der Medizinischen Fakultät der RWTH Aachen